As atividades do PPGEQ são desenvolvidas em regime acadêmico semestral, tendo dois processos seletivos para ingresso no programa em março e em agosto, com disciplinas obrigatórias e eletivas de 4 (quatro) créditos equivalentes a 60 horas-aula. A duração mínima para o aluno concluir o Curso de Mestrado em Engenharia Química no PPGEQ/UFU é de um ano e a máxima dois anos. O candidato ao grau de mestre deverá obter 12 créditos em disciplinas obrigatórias, 2 créditos na Disciplina Seminários de Mestrado e 8 créditos em disciplinas eletivas, bem como a elaboração de uma dissertação de Mestrado. Para os alunos bolsistas da CAPES a disciplina Estágio de Docência na Graduação I também é obrigatória.